南京医科大学是中国著名高等院校之一，其前身是江苏医政学院、国立江苏医学院，创建于1934年，1957年改名为南京医学院。1993年经国家教委批准，更名为南京医科大学。

学校设有基础医学院、第一临床医学院、第二临床医学院、第三临床医学院、口腔医学院、公共卫生学院、药学院、护理学院、医政学院、康达学院和成人教育学院，有3个七年制专业、23个本科专业方向，有2个博士后流动站、10个博士学位授权点、44个硕士学位授权点，有12所附属医院、29所教学医院、24个实习基地（江苏省卫生厅、南京市卫生局、江苏省及各市疾病预防控制中心和卫生监督所、专科医院等），有11个研究所、16个研究中心、5个江苏省重点实验室、7个江苏省重点学科。

学校图书馆藏书42万册，期刊近1万钟，是江苏省医学图书中心馆和高校文献保障系统医学文献中心。学校是中国国家卫生部认可的全国进修基地，接受国内外高访学者、留学生和港澳台学生。

学校现有教授198人，副教授549人，博士生导师62人，硕士生导师278人。各类在校学生数8000余人。

南京医科大学寄生虫学(现更名“病原生物学”)学科于1940年由我国医学寄生虫学教育奠基人洪式闾教授创建，1945年即在国际权威期刊“Nature”上发表我国第一篇论文，1981年被首批确定为博士学位授权点，1993年被首批分别确定为江苏省重点学科和江苏省医学分子生物学重点实验室（2003年重组更名为“江苏省现代病原生物学重点实验室”），2005年被确定为江苏省国家重点学科培育点。本学科点作为我国历史最悠久的医学寄生虫学科之一，一直注重寄生虫学实验技术及研究能力建设和寄生虫种资源库建设。本学科点研制的C6膜检测日本血吸虫尾蚴新方法及其推广和应用，获国家教委科技进步一等奖并获国家专利；我国人体隐孢子虫首例病例的发现及其病原诊断技术的推广应用研究，获国家教委科技进步二等奖。目前本学科点寄生虫种资源库具有原虫标本 6280 件、蠕虫标本 7440 件、昆虫标本 3670 件，合计约17300 件。